Testovanie na rotavírus primárne zahŕňa detekciu vírusových antigénov, nukleových kyselín alebo vírusových častíc vo vzorkách stolice. Bežné metódy zahŕňajú detekciu antigénu koloidného zlata, PCR detekciu nukleových kyselín a elektrónovú mikroskopiu. Špecifická metóda sa má zvoliť na základe klinických symptómov a laboratórnych podmienok.
Bežné metódy detekcie
Detekcia koloidného zlatého antigénu (rýchla detekcia)
Princíp: Táto metóda využíva testovací prúžok z koloidného zlata označený špecifickými protilátkami na identifikáciu rotavírusových antigénov vo výkaloch.
Postup: Malé množstvo vzorky stolice sa zmieša s riedidlom a pridá sa na testovací prúžok. Výsledok je určený farebnými pásmi (pozitívne výsledky ukazujú dva pásy) po 15-30 minútach.
Výhody: Rýchla, jednoduchá obsluha a nízke náklady; vhodné pre ambulancie alebo ústavy primárnej zdravotnej starostlivosti.
Obmedzenia: Nízka citlivosť (približne 80-90%); môžu sa vyskytnúť falošne negatívne výsledky; nedokáže rozlíšiť vírusové podtypy.
PCR detekcia nukleových kyselín
Princíp: Detekcia sa dosiahne amplifikáciou fragmentov špecifických pre rotavírus{0}} (ako sú gény VP6 a VP7).
Postup: Vírusová RNA sa extrahuje z výkalov, reverzne sa prepíše do cDNA a potom sa amplifikuje pomocou PCR. Výsledky sa analyzujú elektroforézou alebo fluorescenčnými sondami.
Výhody: Vysoká citlivosť (takmer 100 %), dokáže rozlíšiť vírusové podtypy (napr. G, P), vhodné pre epidemiologické štúdie.
Obmedzenia: Vyžaduje špecializované vybavenie a technikov; vysoké náklady; dlhá doba spracovania (približne 4-6 hodín).
Enzýmová{0}}imunosorbentná skúška (ELISA)
Princíp: Využíva enzýmom-označené protilátky na naviazanie sa na vírusové antigény a kvantifikuje detekciu prostredníctvom kolorimetrickej reakcie.
Použiteľné scenáre: skríning vzoriek v dávkach alebo scenáre výskumu.
Pozorovanie elektrónovou mikroskopiou
Princíp: Priamo pozoruje rotavírusové častice (zvyčajne v tvare kolieska{0}} vo vzorkách stolice.
Obmedzenia: drahé vybavenie, zložitá prevádzka; klinicky používané zriedka.
